校章の3本のペン先は、知育・徳育・体育の調和のとれた心の豊かな人間の育成を表す。
「北神」の文字は、北楢岡小学校の「北」と神清水小学校の「神」の頭文字であり、地域のまとまりを願い、円の中に「北神」の文字を収めている。
校章制定日:昭和37年4月25日
校章デザイン:石山恭之助
北楢岡小学校と神清水小学校が合併し、新校舎で学ぶ喜びと、学び合いの心構えを示し、校舎から望む鳥海山、地域を流れる雄物川の美しい自然、田園の豊かさを心に刻んで、新しい伝統を築いて欲しいという願いを言葉に託した。
校歌制定日:昭和37年4月25日
校歌作曲者:北神小学校作曲委員会
校歌作詞者:伊藤 建治